Melden Sie sich zuerst an, um alle Funktionen optimal nutzen zu können!

    SHREC 2021: Classification in Cryo-electron Tomograms (Ohne Sprachangabe)

    In: Eurographics Workshop on 3D Object Retrieval ; 5-17  ; 2021

    Wie erhalte ich diesen Titel?

    Zugriff prüfen
    Download
    Kommerziell Vergütung an den Verlag: 14,50 € Grundgebühr: 4,00 € Gesamtpreis: 18,50 €
    Akademisch Vergütung an den Verlag: 4,50 € Grundgebühr: 2,00 € Gesamtpreis: 6,50 €

    Exportieren, teilen und zitieren

    Cryo-electron tomography (cryo-ET) is an imaging technique that allows three-dimensional visualization of macro-molecular assemblies under near-native conditions. Cryo-ET comes with a number of challenges, mainly low signal-to-noise and inability to obtain images from all angles. Computational methods are key to analyze cryo-electron tomograms. To promote innovation in computational methods, we generate a novel simulated dataset to benchmark different methods of localization and classification of biological macromolecules in tomograms. Our publicly available dataset contains ten tomographic reconstructions of simulated cell-like volumes. Each volume contains twelve different types of complexes, varying in size, function and structure. In this paper, we have evaluated seven different methods of finding and classifying proteins. Seven research groups present results obtained with learning-based methods and trained on the simulated dataset, as well as a baseline template matching (TM), a traditional method widely used in cryo-ET research. We show that learning-based approaches can achieve notably better localization and classification performance than TM. We also experimentally confirm that there is a negative relationship between particle size and performance for all methods.

    Inhaltsverzeichnis Konferenzband

    Die Inhaltsverzeichnisse werden automatisch erzeugt und basieren auf den im Index des TIB-Portals verfügbaren Einzelnachweisen der enthaltenen Beiträge. Die Anzeige der Inhaltsverzeichnisse kann daher unvollständig oder lückenhaft sein.

    1
    Shape Classification of Building Information Models using Neural Networks
    Evangelou, Iordanis / Vitsas, Nick / Papaioannou, Georgios / Georgioudakis, Manolis / Chatzisymeon, Apostolos et al. | 2021
    5
    SHREC 2021: Classification in Cryo-electron Tomograms
    Gubins, Ilja / Chaillet, Marten L. / Schot, Gijs van der / Trueba, M. Cristina / Veltkamp, Remco C. / Förster, Friedrich / Wang, Xiao / Kihara, Daisuke / Moebel, Emmanuel / Nguyen, Nguyen P. et al. | 2021
    19
    SHREC 2021: Surface-based Protein Domains Retrieval
    Langenfeld, Florent / Aderinwale, Tunde / Christoffer, Charles / Shin, Woong-Hee / Terashi, Genki / Wang, Xiao / Kihara, Daisuke / Benhabiles, Halim / Hammoudi, Karim / Cabani, Adnane et al. | 2021

    Wie erhalte ich diesen Titel?

    Zugriff prüfen
    Download
    Kommerziell Vergütung an den Verlag: 14,50 € Grundgebühr: 4,00 € Gesamtpreis: 18,50 €
    Akademisch Vergütung an den Verlag: 4,50 € Grundgebühr: 2,00 € Gesamtpreis: 6,50 €

    Exportieren, teilen und zitieren

    Feedback