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SHREC 2021: Surface-based Protein Domains Retrieval (Ohne Sprachangabe)

In: Eurographics Workshop on 3D Object Retrieval   ;  19-26  ;  2021

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Proteins are essential to nearly all cellular mechanism, and often interact through their surface with other cell molecules, such as proteins and ligands. The evolution generates plenty of different proteins, with unique abilities, but also proteins with related functions hence surface, which is therefore of primary importance for their activity. In the present work, we assess the ability of five methods to retrieve similar protein surfaces, using either their shape only (3D meshes), or their shape and the electrostatic potential at their surface, an important surface property. Five different groups participated in this challenge using the shape only, and one group extended its pre-existing algorithm to handle the electrostatic potential. The results reveal both the ability of the methods to detect related proteins and their difficulties to distinguish between topologically related proteins.

Inhaltsverzeichnis Konferenzband

Die Inhaltsverzeichnisse werden automatisch erzeugt und basieren auf den im Index des TIB-Portals verfügbaren Einzelnachweisen der enthaltenen Beiträge. Die Anzeige der Inhaltsverzeichnisse kann daher unvollständig oder lückenhaft sein.

1
Shape Classification of Building Information Models using Neural Networks
Evangelou, Iordanis / Vitsas, Nick / Papaioannou, Georgios / Georgioudakis, Manolis / Chatzisymeon, Apostolos et al. | 2021
5
SHREC 2021: Classification in Cryo-electron Tomograms
Gubins, Ilja / Chaillet, Marten L. / Schot, Gijs van der / Trueba, M. Cristina / Veltkamp, Remco C. / Förster, Friedrich / Wang, Xiao / Kihara, Daisuke / Moebel, Emmanuel / Nguyen, Nguyen P. et al. | 2021
19
SHREC 2021: Surface-based Protein Domains Retrieval
Langenfeld, Florent / Aderinwale, Tunde / Christoffer, Charles / Shin, Woong-Hee / Terashi, Genki / Wang, Xiao / Kihara, Daisuke / Benhabiles, Halim / Hammoudi, Karim / Cabani, Adnane et al. | 2021

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