Analyseverfahren für mRNA einzeln lichtbestrahlter Zellen (German)

2018
  • Patent  /  Electronic Resource

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Verfahren zur Analyse der Nukleinsäuren, insbesondere der mRNA von Zellen, die einzeln mit Licht bestrahlt wurden. In dem Verfahren werden Nukleinsäurekonstrukte in Zellen eingebracht, um genetisch manipulierte Zellen zu erzeugen, die ein durch Einstrahlung von Licht aktivierbares Protein mit der Aktivität einer DNA-Rekombinase kodieren und durch die Wirkung der Rekombinase aus einem weiteren Nukleinsäurekonstrukt verschiedene Markerproteine exprimieren, die optisch detektierbar sind. Mittels der Markerproteine können Zellen optisch, insbesondere lichtmikroskopisch, identifiziert und lokalisiert werden, die die Markerproteine exprimieren, z.B. mittels FACS, und die Nukleinsäuren vereinzelter Zellen, insbesondere deren mRNA, kann analysiert werden, z.B. durch Sequenzieren oder Hybridisieren. Bevorzugt wird das Verfahren ohne Isolierung bzw. Vereinzelung und Abtrennung mit Licht bestrahlter Zellen vor der Analyse ihrer Nukleinsäuren durchgeführt.

A method of analysis of the nucleic acids, especially the mRNA, of cells that have been irradiated individually with light. In the method, nucleic acid constructs are introduced into cells in order to produce genetically manipulated cells that encode a protein activatable by incidence of light and having the activity of a DNA recombinase, and, through the effect of the recombinase, express various marker proteins from a further nucleic acid construct that are optically detectable. By means of the marker proteins, it is possible by optical means, especially by light microscopy, to identify and localize cells that express the marker proteins, for example by means of FACS, and to analyse the nucleic acids of isolated cells, especially the mRNA thereof, for example by sequencing or hybridizing. The method is preferably conducted without isolation or individualization and separation of light-irradiated cells prior to the analysis of their nucleic acids.

  • Title:
    Analyseverfahren für mRNA einzeln lichtbestrahlter Zellen
  • Patent number:
    DE102018216872
  • Application date:
    2018-10-01
  • Patent applicant:
  • Patent family:
  • Author / Creator:
  • Publisher:
    Europäisches Patentamt
  • Year of publication:
    2018
  • Type of media:
    Patent
  • Type of material:
    Electronic Resource
  • Language:
    German
  • Classification:
    IPC:    C12N Mikroorganismen oder Enzyme, MICROORGANISMS OR ENZYMES / C12Q Mess- oder Untersuchungsverfahren unter Einbeziehung von Enzymen, Nukleinsäuren oder Mikroorganismen, MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
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