Die Erfindung betrifft ein Verfahren zur qualitativen Kontrolle mindestens einer spezifischen Eigenschaft mindestens einer Stammzelle, insbesondere ein Verfahren zur Qualitätskontrolle für die Pluripotenz von pluripotenten Stammzellen (PSCs). Die Erfindung betrifft ferner die Verwendung mindestens eines Nukleinsäuremoleküls, welches zumindest ein CpG-Dinukleotid umfasst, zur Bestimmung der keimblatt-spezifischen Differenzierung mindestens einer Stammzelle. Die erfindungsgemäße Lösung beruht dabei auf der epigenetischen Analyse genomischer DNA, wobei neben der qualitativen Pluripotenzanalyse auch die Möglichkeit besteht, das Differenzierungspotential der Zellen abzuschätzen. In Verbindung mit der Differenzierung der iPSCs liefert das erfindungsgemäße Verfahren dem Anwender zusätzlich Informationen über die Differenzierbarkeit der analysierten Stammzellen in die drei Keimblätter, was als wesentliches Qualitätsmerkmal für pluripotente Stammzellen gilt. Die erfindungsgemäßen Signaturen wurden anhand von frühen Differenzierungsstadien während der Entwicklung in Endo-, Meso- und Ektoderm ausgewählt.
The invention relates to a method of qualitative control of at least one specific property of at least one stem cell, especially to a method of quality control for the pluripotency of pluripotent stem cells (PSCs). The invention further relates to the use of at least one nucleic acid molecule comprising at least one CpG dinucleotide for determination of germ layer-specific differentiation of at least one stem cell. The solution of the invention is based on epigenetic analysis of genomic DNA, with not only qualitative pluripotency analysis but also the option of estimating the differentiation potential of the cells. In conjunction with the differentiation of the iPSCs, the method of the invention additionally gives the user information as to the differentiability of the analysed stem cells into the three germ layers, which is considered to be an essential quality feature for pluripotent stem cells. The signatures according to the invention were selected with reference to early differentiation stages during development into endo-, meso- and ectoderm.
L'invention concerne un procédé pour contrôler la qualité d'au moins une propriété spécifique d'au moins une cellule souche, en particulier un procédé pour contrôler la qualité de la pluripotence des cellules souches pluripotentes (PSC). L'invention concerne également l'utilisation d'au moins une molécule d'acide nucléique comprenant au moins un dinucléotide CpG pour déterminer la différenciation spécifique du feuillet embryonnaire d'au moins une cellule souche. L'invention repose sur l'analyse épigénétique de l'ADN génomique. En plus de l'analyse qualitative de la pluripotence, il est également possible d'évaluer le potentiel de différenciation des cellules. Associé à la différenciation des iPSC, le procédé selon l'invention fournit en outre à l'utilisateur des informations sur la capacité de différenciation des cellules souches analysées dans les trois feuillets embryonnaires, ce qui est considéré comme une caractéristique de qualité essentielle pour les cellules souches pluripotentes. Les signatures selon l'invention ont été sélectionnées sur la base des premiers stades de différenciation au cours du développement dans l'endoderme, le mésoderme et l'ectoderme.