Automated Design of Dynamic Programming Schemes for RNA Folding with Pseudoknots (Englisch)
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In:
LIPIcs, Volume 242, WABI 2022
: 22nd International Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI 2022)
;
242
;
7:1-7:24
;
2022
-
ISBN:
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ISSN:
- Aufsatz (Konferenz) / Elektronische Ressource
-
Titel:Automated Design of Dynamic Programming Schemes for RNA Folding with Pseudoknots
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Beteiligte:Marchand, Bertrand ( Autor:in ) / Will, Sebastian ( Autor:in ) / Berkemer, Sarah J. ( Autor:in ) / Bulteau, Laurent ( Autor:in ) / Ponty, Yann ( Autor:in ) / Boucher, Christina ( Herausgeber:in ) / Rahmann, Sven ( Herausgeber:in )
-
Erschienen in:LIPIcs, Volume 242, WABI 2022 : 22nd International Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI 2022) ; 242 ; 7:1-7:24Leibniz International Proceedings in Informatics (LIPIcs) ; 242 ; 7:1-7:24
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Verlag:
- Neue Suche nach: Schloss Dagstuhl – Leibniz-Zentrum für Informatik
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Erscheinungsdatum:26.08.2022
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Format / Umfang:24 pages , 1988869 byte
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Anmerkungen:LIPIcs, Vol. 242, 22nd International Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI 2022), pages 7:1-7:24
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ISBN:
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ISSN:
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DOI:
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Medientyp:Aufsatz (Konferenz)
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Format:Elektronische Ressource
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Sprache:Englisch
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Schlagwörter:
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Lizenzbestimmungen:
-
Datenquelle:
Inhaltsverzeichnis Konferenzband
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Efficient Solutions to Biological Problems Using de Bruijn Graphs (Invited Talk)Salmela, Leena et al. | 2022
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Eulertigs: Minimum Plain Text Representation of k-mer Sets Without Repetitions in Linear TimeSchmidt, Sebastian / Alanko, Jarno N. et al. | 2022
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Predicting Horizontal Gene Transfers with Perfect Transfer NetworksLópez Sánchez, Alitzel / Lafond, Manuel et al. | 2022
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Haplotype Threading Using the Positional Burrows-Wheeler TransformSanaullah, Ahsan / Zhi, Degui / Zhang, Shaoije et al. | 2022
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Non-Binary Tree Reconciliation with Endosymbiotic Gene TransferGascon, Mathieu / El-Mabrouk, Nadia et al. | 2022
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Constructing Founder Sets Under Allelic and Non-Allelic Homologous RecombinationBonnet, Konstantinn / Marschall, Tobias / Doerr¹, Daniel et al. | 2022
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Automated Design of Dynamic Programming Schemes for RNA Folding with PseudoknotsMarchand, Bertrand / Will, Sebastian / Berkemer, Sarah J. / Bulteau, Laurent / Ponty, Yann et al. | 2022
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Fast and Accurate Species Trees from Weighted Internode DistancesLiu, Baqiao / Warnow, Tandy et al. | 2022
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On Weighted k-mer DictionariesPibiri, Giulio Ermanno et al. | 2022
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Accurate k-mer Classification Using Read ProfilesSuzuki, Yoshihiko / Myers, Gene et al. | 2022
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New Algorithms for Structure Informed Genome RearrangementOzery, Eden / Zehavi, Meirav / Ziv-Ukelson, Michal et al. | 2022
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Fast Gapped k-mer Counting with Subdivided Multi-Way Bucketed Cuckoo Hash TablesZentgraf, Jens / Rahmann, Sven et al. | 2022
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A Linear Time Algorithm for an Extended Version of the Breakpoint Double DistanceBraga, Marília D. V. / Brockmann, Leonie R. / Klerx, Katharina / Stoye, Jens et al. | 2022
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Efficient Reconciliation of Genomic Datasets of High SimilarityShibuya, Yoshihiro / Belazzougui, Djamal / Kucherov, Gregory et al. | 2022
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WGSUniFrac: Applying UniFrac Metric to Whole Genome Shotgun DataWei, Wei / Koslicki, David et al. | 2022
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Reconstructing Phylogenetic Networks via Cherry Picking and Machine LearningBernardini, Giulia / van Iersel, Leo / Julien, Esther / Stougie, Leen et al. | 2022
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Feasibility of Flow Decomposition with Subpath Constraints in Linear TimeGibney, Daniel / Thankachan, Sharma V. / Aluru, Srinivas et al. | 2022
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Prefix-Free Parsing for Building Large Tunnelled Wheeler GraphsGoga, Adrián / Baláž, Andrej et al. | 2022
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Pangenomic Genotyping with the Marker ArrayMun, Taher / Vaddadi, Naga Sai Kavya / Langmead, Ben et al. | 2022
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Suffix Sorting via Matching StatisticsLipták, Zsuzsanna / Masillo, Francesco / Puglisi, Simon J. et al. | 2022
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A Maximum Parsimony Principle for Multichromosomal Complex Genome RearrangementsSimonaitis, Pijus / Raphael, Benjamin J. et al. | 2022
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Locality-Sensitive Bucketing Functions for the Edit DistanceChen, Ke / Shao, Mingfu et al. | 2022
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phyBWT: Alignment-Free Phylogeny via eBWT Positional ClusteringGuerrini, Veronica / Conte, Alessio / Grossi, Roberto / Liti, Gianni / Rosone, Giovanna / Tattini, Lorenzo et al. | 2022
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Gene Orthology Inference via Large-Scale Rearrangements for Partially Assembled GenomesRubert, Diego P. / Braga, Marília D. V. et al. | 2022
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Toward Optimal Fingerprint Indexing for Large Scale GenomicsAgret, Clément / Cazaux, Bastien / Limasset, Antoine et al. | 2022